El gobierno del presidente Lenín Moreno ha decidido devolver la gestión del Hospital Universitario a la Universidad de Guayaquil y ha ofrecido restaurar, hasta el próximo año, los laboratorios de investigación científica.
El Secretario de Educación Superior, Adrián Bonilla dijo que la decisión de devolver la gestión del Hospital a la Universidad, lleva el propósito de convertirlo en un centro de formación, de excelencia, de investigación y capacitación docente para el fortalecimiento de las carreras de salud en la Universidad de Guayaquil.
En el 2005, la Academia inauguró el centro hospitalario, y en el régimen de Correa, la administración pasó al Ministerio de Salud con la oferta de mejorar la inversión en equipamiento e infraestructura.